本文以矽聯科技為例說明營業稅媒體申報操作流程。本公司設有總公司與一個辦事處，共兩個統一編號與稅籍，由總公司統一申報營業稅。銷項發票資料由 e首發票 系統產出，格式直接符合媒體申報規範。
前置作業：設定基本檔
進入媒體申報軟體，首先設定公司基本檔，依序輸入各統編的公司資訊。
前置作業：輸入進項發票
輸入進項發票（本公司尚未導入 B2B 電子發票，進項發票須自行手動輸入）。
確定進項發票輸入完成後，先執行審核，確認無誤後匯出進銷存檔案（進項，兩個統編）。
銷項發票準備
由 e首發票 系統中分別產出兩個統編的銷項資料檔，格式已符合媒體申報規範，無需另行轉換。
十二步驟操作流程
一、合併進銷項資料（方法擇一）
方法 1：用記事本開啟進項發票的文字檔，將銷項發票文字檔內容複製後貼在其後，合併為同一檔案。
方法 2：使用申報軟體「其他」功能中的「合併」選項，將兩個檔案合併。
二、輸入銷項發票本數
三、轉入進銷存資料
四、產生空白發票
1. 進入銷項資料，確認匯入的銷項資料正確無誤。
2. 按「產生空白發票」按鈕。
五、產出進銷存資料並合併申報檔
檔案合併說明
按下此作業後，系統分別產出：
- 89430377.txt（總公司）
- 26039959.txt（辦事處）
因為合併申報，需將上述兩檔再次合併，統一命名為 89430377.txt（合併方法同步驟一）。
六、進銷審核
如有錯誤，需回進銷項修改，重新產出合併後再次審核，重複直到審核通過。
七、申報檔產出
- 輸入 26039959（辦事處）→ 產出申報檔一，存檔
- 輸入 89430377（總公司）→ 選擇「分支機構申報」→ 產出申報檔二，存檔
- 再次輸入 89430377 → 選擇「彙總申報」→ 產出申報檔三，存檔
完成後檢視申報表，核對無誤再進行下一步。
八、申報書轉出
不輸入統編，讓系統將全部統編的申報書一次轉出。
九、申報書審核
勾選所有統編，一次全部審核。
十、勾稽審核
十一、選擇繳稅方式
十二、申報上傳與列印繳款書
完成上傳後，申報作業即告完成。請記得列印繳款書並於繳款期限內完成繳款。
常見問題 FAQ
e首發票系統產出的銷項資料，可以直接用於媒體申報嗎？
可以。e首發票系統產出的銷項資料格式符合財政部媒體申報規範，可直接匯入申報軟體使用，無需額外轉換。這是電子發票系統的核心優勢之一，大幅減少人工作業。
兩個統編的資料，在哪些步驟需要合併？
需合併兩次：第一次在步驟一，將兩個統編的進銷項原始資料檔合併；第二次在步驟五，將系統分別產出的 89430377.txt 與 26039959.txt 合併成一個 89430377.txt，作為彙總申報的基礎。
步驟七要產出幾個申報檔？分別是什麼？
共需產出三個申報檔：① 輸入辦事處統編（26039959）產出申報檔一；② 輸入總公司統編（89430377）選擇「分支機構申報」產出申報檔二；③ 再次輸入總公司統編選擇「彙總申報」產出申報檔三。三份均需存檔備用。
進銷審核或勾稽審核發現錯誤怎麼辦？
需回到進銷項修正錯誤，重新產出合併後再執行審核，重複此流程直到審核全部通過。只有審核通過後，才可繼續進行申報書轉出，切勿跳過審核直接上傳。